La Cellule anti-terroriste (CAT, en français) ou Counter Terrorist Unit (CTU, en anglais) est une branche fictive de la CIA. Son siège est situé à Washington, DC mais le feuilleton se centre principalement sur la cellule de Los Angeles.
Dans la première saison, la branche de Los Angeles est dirigée par l'agent spécial Jack Bauer qui quitte ensuite celle-ci après la mort de sa femme Teri, tuée par Nina Myers. Entre temps, Jack à été suppléé par Alberta Green, après que celui-ci ait été considéré comme fugitif.
George Mason prend le contrôle de la cellule jusqu'à l'épisode 9 de la deuxième saison. Tony Almeida va le remplacer et reste le directeur de la branche de Los Angeles pour le reste de la saison, et pour une partie de la troisième saison, jusqu'à ce qu'il aide un ancien agent du MI6 devenu terroriste (Stephen Saunders) à s'échapper. En effet, celui-ci avait pris en otage Michelle Dessler, la femme de Tony. Jack Bauer prend alors le contrôle de la cellule temporairement, jusqu'à l'arrivée de Brad Hammond.
Dans la quatrième saison, une nouvelle directrice est arrivée à la CAT, il s'agit de Erin Driscoll, qui démissionnera suite au suicide de sa fille Maya atteinte de schizophrénie. Tony reprendra le poste laissé vacant en attendant que la division envoie un ou plutôt une remplaçante. C'est Michelle qui prendra la place de Tony jusqu'à la fin de la saison 4. À la fin de cette journée, Tony et Michelle décident de se remettre ensemble et donc quittent leur travail respectif à la CAT.
C'est alors Bill Buchanan qui prend le commandement de la cellule, jusqu'au 16ème épisode de la saison 5 (il est "renvoyé chez lui pour se reposer" aux alentours de 22h30 environ) suite à une brèche importante de leur système de sécurité lors de l'attaque au gaz neuro-toxique (ayant tué plus de 40% du personnel) étant survenue quelques heures auparavant. La CAT est alors absorbée par le département de la défense (Homeland Security) et est alors dirigée par Karen Hayes. Après les efforts fournis par la CAT avec des évènements s'étant déroulés lors de la saison 5, le pouvoir exécutif n'a eu d'autre choix que de remettre l'autorité du bâtiment fédéral en bonne et due forme.
Durant la saison 6, Bill Buchanan dirige la Cellule avant sa démission forcée dans l'épisode 19. Son bras droit, Nadia Yassir, reprend les rênes jusqu'à la fin de cette épuisante journée.
Quelques mois après le Day 6, la CAT de Los Angeles a été démantelée par la justice suite à des abus de procédures et des infractions multiples du protocole par notamment Jack Bauer, qui est cité pour comparaitre devant une commission sénatoriale pour répondre de ses crimes passés lors des premiers épisodes de la saison 7.
La CAT fera son retour dans la série. L'action ne se déroulera plus à L.A (saisons 1 à 6), ni à Whasington (saison 7) mais à New York (saison 8 )
La Division :
La Cellule-Anti Terroriste est sous le contrôle du QG de la division de la cellule, simplement appelée « Division » dans la série.
Richard Walsh est le directeur administratif de la division, en charge de la cellule de L.A : il est abattu dès le 2ème épisode de la saison 1.
La division est dirigée jusqu'à la troisième saison par le directeur régional Ryan Chapelle. Ryan Chapelle est exécuté par Jack Bauer, après qu'il eut l'accord, à contre-cœur, du président David Palmer, suivant l'ordre de Stephen Saunders.
Dans la saison 4, c'est Bill Buchanan qui est directeur de la division. En tant qu'agence gouvernementale, la cellule est aussi sous le contrôle du président des États-Unis.
Dans la saison 5, c'est Lynn McGill qui sera le responsable de la Division, mais ce dernier sera affecté à la CAT de L.A. en tant que "Superviseur" ce qui ne plaira pas aux agents. Il meurt héroïquement au milieu de la saison, victime des effets du gaz neurotoxique...